- وضع الأسس والمعايير والشروط والضوابط لمزاولة مهنة الطب البديل والتكميلي.

- وضع الأدلة والإجراءات الخاصة بالطب البديل والتكميلي.

- إجراء المسوحات والدراسات والبحوث المتعلقة بالطب البديل والتكميلي.

- إصدار التراخيص بمزاولة الطب البديل والتكميلي.

- مراقبة نشاطات المرخص لهم بممارسة الطب البديل والتكميلي أفراداً ومؤسسات وتقويمها.

- المشاركة في تحديد الرسوم التي يتقاضاها ممارسو الطب البديل والتكميلي بحسب الخبرة والخدمة المقدمة والتأهيل.

- تأسيس قاعدة معلوماتية للطب البديل والتكميلي.

- إصدار التقارير والنشرات والدوريات العلمية, وتقديم برامج التوعية وعقد الندوات والمؤتمرات في مجال الطب البديل والتكميلي.

- عقد الدورات وبرامج التعليم والتدريب المستمر للمتعاملين في مجال نشاطات الطب البديل والتكميلي.

- وضع الضوابط والمعايير للمحافظة على توثيق علوم الطب البديل والتكميلي وبخاصة الطب الإسلامي والعربي.

- اقتراح الميزانية السنوية اللازمة لتوفير الاحتياجات البشرية والمادية والأجهزة والأدوات والمستلزمات والأثاث للمركز.

- التنسيق مع الجهات الصحية والتعليمية والبحثية المختلفة في مجال الطب البديل والتكميلي سواء داخل المملكة أو خارجها.

- إصدار مجلة علمية متخصصة بالطب البديل والتكميلي.

- القيام بأي مهمة أخرى يكلف بها ضمن اختصاصه.